İnci kefalı üyesi bulunduğu sazangiller familyasındaki bir çok balık gibi plankton ağırlıklı olarak beslenmektedir. Besinleri arasındaki fitoplankton ve zooplanktonların oranı balığın büyüklüğüne ve dönemlere göre değişme göstermektedir. Van Gölü tuzlu ve sodalı suları yüzünden biyolojik çeşitlilik açısından fakir bir ekosistemdir. Yapılan çalışmalara göre şimdiye kadar 103 tür fitoplankton, 36 tür zooplankton tespit edilmiştir (Selçuk, 1993).  Ancak inci kefalının biyolojisi ile ilgili yapılan çalışmalarda, örneklenen balıkların mide muhteviyatı analizleri sonucunda aslında inci kefalının Chrinomidler ve Copepodlar olmak üzere iki ana besin kaynağı olduğu kanaati oluşmuştur. İnci kefalı yavru ve genç balık döneminin başında daha çok fitoplanktonlarla beslenmektedir. Fitoplanktonlar arasında en çok tercih edilenler ise Diatomelerdir. Büyüdükçe günlük dieti içindeki fitoplankton oranı azalırken, zooplankton oranı artmaktadır. Ergin balıklar ise daha çok Chrinomid ve Copepodları tercih etmektedir. 

Zooplanktonlar içinde inci kefalının en önemli besin kaynağı Calonoid Copepodlardır. Özellikle kış aylarında yapılan çalışmalarda balıkların midesinin neredeyse tamamının Copepodlarla dolu oluduğu görülmektedir (Akgül 1984, Danulat and Selcuk  1992, Selçuk 1993, Sarı 1997, Sarı 2005).  Sonuç olarak inci kefalı tipik bir plantivordur. Genç yaşlarda daha çok fitoplanktonla, ileri yaşlarda ve özellikle kış aylarında daha çok zooplanktonlarla beslenmektedir.